Nas biofábricas a produção de microrganismos biológicos para uso próprio denomina-se "On Farm" onde são produzidos microrganismos (bactérias e fungos) que são benéficos para a plantação ensejando seu uso nela. A produção é chamada de bioinsumos, sendo realizada com rigoroso controle de qualidade em todo o processo. Para melhor aferição da qualidade dos bioinsumos, a Araporã Bioenergia, além de sua Biofábrica, também instalou um laboratório de análise que realiza a contagem dos microrganismos produzidos.
Os bioinsumos produzidos possuem diversas finalidades tais como: promotores de crescimento de plantas, inoculantes, biofertilizantes, nutrição vegetal e defensivos biológicos. Dessa maneira auxiliam no combate a pragas e doenças, aumentam a fertilidade do solo e ajudam na disponibilidade de nutrientes para as plantas de forma sustentável.
